Trải qua quá trình hình thành và phát triển, thị xã Phú Mỹ đang từng bước chuyển dịch cơ cấu kinh tế theo hướng tăng tỷ trọng công nghiệp – thương mại dịch vụ, giảm dần tỷ trọng nông nghiệp. Diện tích sản xuất nông nghiệp của Phú Mỹ vì thế dần thu hẹp.

Và để thích ứng với bối cảnh mới, nông nghiệp ở địa phương này đang chuyển hướng sang nông nghiệp đô thị, ứng dụng công nghệ cao.