Cụm cảng Cái Mép - Thị Vải được xác định là cảng đặc biệt quốc gia, đảm nhận vai trò là cảng trung chuyển quốc tế. Cùng với quá trình hoạt động phát triển, cụm cảng này đang gặp không ít khó khăn, đặc biệt là những vướng mắc liên quan đến cơ chế, chính sách hải quan.